В Киевском НИИ общей и коммунальной гигиены в течение длительного периода проводятся исследования по очистке сточных вод предприятий угледобывающей и углеперерабатывающей промышленности с помощью микробного метода (метода чистых .культур). Используя культуру фенолразрушающих бактерий, можно добиться эффективности очистки сточных вод от фенолов, равной 99,5—99,9%. Микробиологическое изъятие фенолов возможно также из сточных вод другого происхождения, например от газогенераторных станций. При этом, из сточных вод удаляются метиловый спирт, пиридин, уксусная кислота, бензол, нафталин, бенз/а/пирен и другие соединения. Получен положительный результат по очистке микробным методом сточных вод, содержащих роданистые соли и цианистые соединения.

Дозу ила в аэротенке можно увеличить, добавив в нее инертный носитель биомассы. В начале 60-х годов во Всесоюзном НИИ жиров была разработана конструкция биоокислителя, в котором одновременно производятся отстаивание сточных вод, их предварительная аэрация воздухом, биологическая очистка, осветление и дезинфекция. Особенность этой установки состоит в наличии биощитов, расположенных в зоне аэрации, вследствие чего этот метод называется биощитовой.